玉米基因组数据集

数据集总体介绍

和水稻和小麦一样,玉米是一种非常重要的农作物。在美国,它是最重要的经济作物。除了用作谷物和饲料外,它还广泛应用于制药生产,以及作为其他有机化工产品如橡胶、乙醇和塑料的原料。除了经济上的重要性之外,几十年来它已经成为一个经典的植物遗传研究模型。玉米核基因组是双二倍体——两个二倍体基因组的融合(Helentjaris T, Weber D, Wright S. 1988)或异源多倍体(Wilson WA et al. 1999)具有旋钮异染色质。旋钮异染色质是185 bp元件(Peacock WJ et al. 1981)和350 bp元件(Ananiev EV et al. 1998)的重复。在不同的玉米品种之间,大量的复制信息在3至4个数量级之间变化。这导致了玉米之间的基因组大小范围广泛。最小的估计为2400 Mbp,具有高比例的重复DNA。当代美国玉米作物是将各种性状渗入一组玉米品种的结果。族谱显示,每种玉米的两个不同的组合是:北方燧石和南方凹痕[(Allard RW. 1999); (Doebley et al. Econ Bot 1988 42:120-131)]。玉米基因组亚种(玉米)核苷酸序列的第一份草案于2007年2月28日在第五十届玉米遗传会议上予以公布。

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